Menu

Japan Week Spokane

Examen des tests de diagnostic rapide utilisés par les programmes de gestion des antimicrobiens

Les tests microbiologiques rapides permettent aux programmes de gestion des antimicrobiens d’améliorer l’utilisation des antimicrobiens et les résultats cliniques et économiques. Les techniques standard d’identification des organismes nécessitent au moins des heures pour les résultats finaux, comparés aux tests diagnostiques rapides qui permettent d’identifier les organismes en quelques heures. les tests microbiologiques sont considérés comme des «changeurs de jeu» et représentent une avancée significative dans la gestion des maladies infectieuses Cette revue se concentre sur les tests de diagnostic rapide actuellement disponibles et, surtout, sur l’impact des tests rapides en combinaison avec la gestion des antimicrobiens.

gestion des antimicrobiens, test de diagnostic rapide, résultats, coûtsUn concept clé dans le domaine des maladies infectieuses est l’identification des organismes avec des tests subséquents de sensibilité aux antimicrobiens. Cette information est essentielle au choix du traitement antimicrobien approprié. l’administration dans les premières heures de la reconnaissance du sepsis est critique Kumar et ses collègues ont démontré la nature critique de l’administration opportune d’antibiotiques chez les patients atteints de choc septique, chaque heure de retard au cours des premières heures entraînant une diminution de la survie en% illustre l’importance du concept de «faire les premiers pas» Les techniques standard d’identification des organismes reposent sur des méthodes phénotypiques, qui nécessitent – des heures pour fournir des résultats définitifs, comparés aux tests de diagnostic rapides, qui fournissent des résultats définitifs en quelques heures de croissance. ont démontré t Les tests microbiologiques rapides profitent au patient en permettant une optimisation antimicrobienne en temps opportun, ce qui peut réduire la mortalité, raccourcir le séjour à l’hôpital et réduire les coûts d’hospitalisation. Les tests microbiologiques rapides sont considérés comme des «changements de jeu» et représentent un progrès important dans la gestion. des maladies infectieuses Cette revue se concentre sur les tests de diagnostic rapide actuellement disponibles, et, surtout, sur l’impact des tests rapides en combinaison avec la gestion des antimicrobiens sur les résultats pour les patients.

METHODES MICROBIOLOGIQUES TRADITIONNELLES POUR L’IDENTIFICATION D’ORGANISMES

Les laboratoires de microbiologie hospitalière fournissent diverses méthodes d’identification des organismes, y compris la coloration de Gram et les tests biochimiques rapides en combinaison avec des techniques de culture. Les méthodes microbiologiques traditionnelles demeurent sous-optimales pour l’identification rapide et les tests de susceptibilité. fournir des résultats d’analyse d’organisme et de sensibilité aux antimicrobiens à un clinicien était de plusieurs heures Le besoin de résultats rapides est évident, et les méthodes actuelles d’identification moléculaire rapide peuvent donner des résultats en quelques minutes à quelques heures.

PROCÉDÉS MOLÉCULAIRES RAPIDES D’IDENTIFICATION D’ORGANISME

Il existe plusieurs tests moléculaires rapides disponibles dans le commerce pour la détection d’organismes. Un résumé des tests est présenté dans le tableau.

Non Oui Complexité modérée Xpert C difficile / Epi C difficile PCR Gen-Sonde Prodesse Oui Non Oui Non évalué ProGastro Cd Assay Staphylococcus spp, Streptococcus spp, E faecalis, E faecium, Micrococcus spp, Listeria spp Multiplex PCR Nanosphère Non Non Oui Complexité modérée Verigène : BC-GP Escherichia coli à Gram négatif, Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella pneumoniae, PNA QuickFISH AdvanDx Non Non Non Feu de signalisation GNR hautement complexe PNA QuickFISH E coli, K pneumoniae, Klebsiella oxytoca, P aeruginosa, Serratia marcescens, Acinetobacter spp, Proteus spp, Citrobacter spp, Enterobacter spp & lt; Multiplex PCR Nanosphere Non Non Oui Non noté Verigène: hémocultures Gram négatif Pathogènes fongiques Candida albicans, Candida parapsilosis, Candida tropicalis, Candida glabrata, Candida krusei PNA POISSON AdvanDx Oui Non Non Grande complexité Feu de levure Feu PNA Poisson Autre Multiples bactérien, fongique, et pathogènes viraux Multiplex PCR BioFire Diagnostics Oui Non Oui Complexité modérée FilmArray Système et panneaux pathogènes multiples bactériens et fongiques directs du sang avant la culture PCR Roche Molecular Systemsa Oui Non Oui Non évalué LightCycler SeptiFast Test MGRADE Multiples pathogènes bactériens et fongiques MALDI-TOF MS Bruker Société Non Oui Oui Grande complexité MALDI Biotyper CA Multiples pathogènes bactériens et fongiques – MALDI-TOF MS bioMérieux Non Oui Oui Grande complexité VITEK MS Multiples agents pathogènes bactériens et fongiques – Optique bioMérieux Non Oui Non Complexité VITEK Organisme Temps de détection, h Technologie Fabricant Besoins en lots pour la colonie pure Désignation CLIA automatisée Nom commercial Staphylococcus aureus à Gram positif, PNA CoNS QuickFISH AdvanDx Non Non Non Complexe S aureus / CoNS PNA QuickFISH MRSA Immunochromatographie Alere Scarborough, Inc Non Oui Non Complexité modérée Alere PBPa Culture Test de colonie S aureus Immunochromatographie Alere Scarborough, Inc Non Non Non Non évalué BinaxNOW S aureus MSSA, SARM – milieu chromogénique BD Non Oui Non Haute complexité BBL CHROMagar MRSA II SARM PCR Roche Diagnostics USA Oui Non Oui Complexité élevée LightCycler SARM SASA, MRSA, CoNS Multiplex PCR BD GeneOhm Oui Non Oui Grande complexité BD GeneOhm Staph SRSSM, SARM, CoNS Multiplex PCR Céphéide Non Non Oui Complexité modérée Xpert SARM / SA BC SASM, SARM Multiplex PCR Céphéide Non Non Oui Complexité modérée Xpert SARM / SA SSTI S aureus, Staphylococcus epidermidis PCR multiplex N anosphère Non Non Oui Complexité modérée Verigène: BC-GP Enterococcus faecalis, Enterococcus faecium PNA Quickfish Adrian Non Non Non Complexité élevée Enterococcus faecalis / OE PNA Quickfish Clostridium difficile LAMP Meridian Bioscience Oui Non Oui Complexité modérée Illumigene C difficile C difficile PCR BD GeneOhm Oui Non Oui Non évalué BD GeneOhm Cdiff Assay C difficile Multiplex PCR Céphéide Non Non Oui Complexité modérée Xpert C difficile C difficile Multiplex PCR Céphéide Non Non Oui Complexité modérée Xpert C difficile / Epi C difficile PCR Gen-Probe Prodesse Oui Non Oui Non évalué ProGastro Cd Assay Staphylococcus spp, Streptococcus spp, E faecalis, E faecium, Micrococcus spp, Listeria spp Multiplex PCR Nanosphère Non Non Oui Complexité modérée Verigène: BC-GP Escherichia coli à Gram négatif, Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella pneumoniae, PNA QuickFISH AdvanDx Non Non Non Grande complexitéGNR feu de signalisation PNA QuickFISH E coli, K pneumoniae, Klebsiella oxytoca, P aeruginosa, Serratia marcescens, Acinetobacter spp, Proteus spp, Citrobacter spp, Enterobacter spp & lt; Multiplex PCR Nanosphere Non Non Oui Non noté Verigène: hémocultures Gram négatif Pathogènes fongiques Candida albicans, Candida parapsilosis, Candida tropicalis, Candida glabrata, Candida krusei PNA POISSON AdvanDx Oui Non Non Grande complexité Feu de levure Feu PNA Poisson Autre Multiples bactérien, fongique, et pathogènes viraux Multiplex PCR BioFire Diagnostics Oui Non Oui Complexité modérée FilmArray Système et panneaux pathogènes multiples bactériens et fongiques directs du sang avant la culture PCR Roche Molecular Systemsa Oui Non Oui Non évalué LightCycler SeptiFast Test MGRADE Multiples pathogènes bactériens et fongiques MALDI-TOF MS Bruker Société Non Oui Oui Grande complexité MALDI Biotyper CA Multiples pathogènes bactériens et fongiques – MALDI-TOF MS bioMérieux Non Oui Oui Grande complexité VITEK MS Multiples pathogènes bactériens et fongiques – Optique bioMérieux Non Oui Non Grande complexité VITEK Abréviations: BC-GP, blo od culture gram-positive; CLIA, Modifications Cliniques d’Amélioration de Laboratoire; CoNS, staphylocoques à coagulase négative; FISH, hybridation fluorescente in situ; LAMP, amplification isotherme à médiation par boucle; MALDI-TOF MS, désorption laser assistée par matrice / ionisation-spectrométrie de masse à temps de vol; SARM, S aureus résistant à la méthicilline; SASM, S aureus sensible à la méthicilline; PCR, amplification en chaîne par polymérase; PNA, acide nucléique peptidique; SSTI, infections de la peau et des tissus mous Tous les tests sont approuvés par la Food and Drug Administration des États-Unis à l’exception du système de PCR moléculaire de Roche.

Réaction en chaîne de la polymérase

Réaction en chaîne par polymérase PCR utilise une sonde marquée par fluorescence avec des amorces pour amplifier un morceau d’ADN cible Cette technique combine l’amplification et la détection dans le processus Il existe plusieurs tests approuvés par la Food and Drug Administration des États-Unis qui utilisent la PCR en temps réel. LightCycler SeptiFast MecA de Molecular System, le test Cdiff de BD GeneOhm, le test Xpert C difficile de Cepheid et le ProGastro Cd de Gen-Probe Prodesse

PCR multiplex

La PCR multiplexe utilise une sonde marquée par fluorescence mais & gt; Cette méthode peut être utilisée pour la détection simultanée de plusieurs organismes et marqueurs de résistance Actuellement, le test Staph SR de BD GeneOhm, la culture sanguine Xpert MRSA / SA de Cepheid et les tests C difficile / Epi, et le panel BCID d’identification de la culture sanguine FilmArray de BioFire Diagnostics Les tests BCID de FilmArray pour les organismes, y compris les espèces Staphylococcus, Enterococcus, Listeria monocytogenes, Streptococcus, Acinetobacter baumannii, Haemophilus influenzae, Neisseria meningitidis, Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter cloacae, Escherichia coli, Klebsiella, Proteus, Serratia marcescens, et les espèces de Candida En outre, les gènes de résistance aux antimicrobiens sont également détectés, y compris mecA, vanA / B, et la résistance aux carbapénèmes

Extraction d’acide nucléique de technologie de sonde de nanoparticule et amplification de PCR

Le test BC-GP Gram-positif de culture de sang Verigene de Nanosphere utilise l’extraction d’acide nucléique et l’amplification PCR d’un échantillon clinique suivi d’une hybridation de l’ADN cible pour capturer des oligonucléotides sur un microarray Après hybridation, l’amplification des sondes hybrides fournit une analyse qualitative automatisée des résultats. Le test GP permet d’identifier rapidement la présence des organismes suivants: Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis, Staphylococcus lugdunensis, Streptococcus anginosus, Streptococcus agalactiae, Streptococcus pneumoniae, Streptococcus pyogenes, Enterococcus faecalis, Enterococcus faecium et Listeria species En outre, le BC-GP test Gram négatif de culture de sang Verigene de vanBNanosphere identifie le genre, l’espèce et les déterminants de la résistance génétique pour un large panel de bactéries Gram négatif directement à partir de flacons d’hémoculture positifs, y compris E. coli, K pneumoniae , Kl Ebsiella oxytoca, Pseudomonas aeruginosa, espèces d’Acinetobacter, espèces de Proteus, espèces de Citrobacter et espèces d’Enterobacter Le test peut discerner les marqueurs de résistance pour les gènes KPC, NDM, CTX-M, VIM, IMP et OXA. date, il n’y a pas d’études publiées démontrant son impact sur les soins aux patients

Hybridation in situ fluorescente de l’acide nucléique peptidique

PNA FISH AdvanDx, Woburn, Massachusetts a été l’un des premiers tests de diagnostic rapide disponible dans le commerce à partir de cultures sanguines PNA FISH utilise des sondes oligonucléotidiques synthétiques marquées par fluorescence La charge neutre de la molécule synthétique permet une hybridation rapide aux espèces. Après l’hybridation, la fluorescence est détectée à l’aide d’un microscope à fluorescencePNA FISH utilise une variété de sondes actuellement approuvées, y compris pour S aureus, staphylocoques coagulase négative CoNS, E faecalis et autres entérocoques, E coli, K pneumoniae, P aeruginosa, Candida albicans, Candida glabrata, Candida parapsilosis, Candida krusei, et Candida tropicalis AdvanDx Fait important, la méthodologie pour PNA FISH a considérablement changé depuis son introduction initiale Le temps d’exécution initial a pris des heures d’une coloration de Gram positive à PNA FISH result Récemment, à dec temps d’identification, PNA FISH a été modifié avec le développement de la plate-forme de test QuickFISH Cela a réduit le délai d’exécution de la coloration de Gram au résultat final en minutes Important, ceci permet la notification simultanée du résultat Gram et PNA FISH

Spectrométrie de masse à temps de vol avec désorption laser / ionisation assistée par matrice

La spectrométrie de masse MALDI-TOF MS fournit une technologie rapide et est capable d’analyser des milliers d’échantillons par jour à partir de diverses sources, y compris le sang, les voies respiratoires, l’urine et la spectrométrie de masse des plaies. ionisation et désintégration d’une molécule cible Le rapport masse / charge des fragments moléculaires résultants est analysé pour produire une signature moléculaire. Le spectre de masse généré fournit un profil ou une empreinte de l’organisme qui est comparé à ceux d’organismes bien caractérisés dans une base de données. , MALDI-TOF MS plates-formes sont disponibles aux États-Unis, MALDI Biotyper Bruker Corporation, Billerica, Massachusetts et Vitek MS System bioMérieux, Durham, Caroline du Nord

TESTS MICROBIOLOGIQUES ET GÉRANCE ANTIMICROBIENNE

Staphylococcus aureus

Les infections à Staphylococcus aureus constituent un fardeau énorme pour les hôpitaux aux États-Unis. La bactériémie à S. aureus nécessite un diagnostic microbiologique rapide et une administration d’antibiotiques. La vancomycine est considérée comme un traitement standard contre la bactériémie à S. aureus résistante à la méthicilline. cependant, des études ont démontré que la vancomycine est associée à des limitations significatives Si la bactérie est identifiée comme S aureus MSSA sensible à la méthicilline, la vancomycine s’est révélée moins active contre la MSSA que les β-lactamines antistaphylococciques, y compris la nafcilline et la céfazoline Tableau Carver et ses collègues ont évalué l’utilisation du test PCR pour le gène mecA combiné avec les interventions des pharmaciens pour les maladies infectieuses chez les patients atteints de bactériémie à S. aureus Utilisation de leur microbiologie le propre test de PCR du laboratoire, les auteurs ont démontré une réduction de -heure du temps pour obtenir des heures optimales d’antibiothérapie ± heures à heures ± heures; P = avec la combinaison d’un test rapide et d’une intervention par rapport au test rapide seul

Tableau Sommaire des études de diagnostic rapide et du test de surveillance des antimicrobiens et de l’étude de diagnostic Organismes Résultats de la population Verigene: BC-GP Sango et al Enterococcus spp patients présentant une bactériémie entérococcique documentée pré-BC-GP, post-BC-GP Temps moyen pour l’antimicrobien approprié le traitement était plus court dans le groupe post-intervention que dans le groupe pré-intervention. P = Dans le groupe post-intervention, la durée d’hospitalisation était significativement plus courte d; P = et les coûts hospitaliers moyens étaient inférieurs à ceux du groupe de pré-intervention MALDI-TOF MS Perez et al Patients à Gram négatif avec bactériémie à Gram négatif survivant à la pré-hospitalisation, intervention SM MALDI-TOF et tests de sensibilité aux antimicrobiens réalisés directement sur des hémocultures positives combinées à une notification en temps réel et à une intervention du pharmacien d’ID a abouti à une réduction de -heure P = dans le temps de l’optimisation des antibiotiques par rapport aux méthodes conventionnelles; les résultats rapides et l’intervention ont amélioré le temps de traitement actif par h chez les patients ayant une thérapie empirique inactive P & lt; Diminution de LOS d vs d; P = et réduction des coûts hospitaliers par patient $ vs $; P = ont également été observés Huang et al Les organismes aérobies Gram positif et Gram négatif et les levures isolent les patients atteints de bactériémie ou de pré-intervention de candidémie, groupe d’intervention d’intervention: temps diminué à l’identification d’organisme de vs h, P & lt; , temps amélioré pour l’antibiothérapie efficace de vs h P =, et antibiothérapie optimale vs h; P & lt; , -diminution de jour du LOS P = et mortalité réduite% vs%; P = Clerc et al Patients à Gram négatif avec un premier épisode de bactériémie à Gram négatif conduisant à une consultation d’ID L’addition de MALDI-TOF MS pour l’identification rapide des isolats Gram négatif des hémocultures positives suite aux résultats de coloration de Gram a influencé le choix de antibiotique pour un plus grand pourcentage de patients avec une consultation d’ID comparé aux résultats de coloration de Gram seul% vs%; P = NR Wenzler et al Acinetobacter baumannii patients atteints de pneumonie et / ou bactériémie pré intervention, l’intervention MALDI-TOF MS combiné avec des interventions d’intendance a entraîné une réduction significative du temps de traitement efficace h vs h; P & lt; et augmentation de la guérison clinique% vs%; P = Perez Patients à Gram négatif ayant une bactériémie à Gram négatif résistante aux antibiotiques préintervention, intervention Les tests de diagnostic rapide avec gestion ont amélioré le temps nécessaire pour obtenir un traitement antibiotique optimal h vs h; P & lt; La mortalité parmi les patients pendant la période d’intervention était inférieure% vs%; P = Xpert SARM /

assoupli par d vs d; P =, les coûts liés à l’infection ont diminué de $ $ par rapport à $; Patients atteints de SARM avec SSTI purulente Aucune réduction significative de la prescription empirique excessive d’antibiotiques SARM-actifs en l’absence d’une stratégie efficace de mise en œuvre de la gérance. FISH PNA Forrest et al patients atteints de CoNS CoNS, avec hémocultures positives avec GPCC non testé dans la même période de temps dans le groupe témoin Cas patients: réduction significative du LOS médian de à d dans le groupe PNA PISH P & lt; ; CI, -; Schweizer et al S aureus patients atteints de bactériémie admis entre et Parmi les patients ayant reçu un traitement antimicrobien approprié, le délai de traitement approprié a été plus court chez les patients qui ont été admis après l’introduction du test PNA FISH par rapport à mise en œuvre de FISH pré-PNA d vs d; P = Holtzman et al S aureus, patients CoNS pré-PNA FISH, post-PNA FISH Aucune réduction de LOS ou de vancomycine L’étude n’incluait pas de notification active ou d’intervention antimicrobienne Forrest et al Enterococcus spp patients hospitalisés période de pré-intervention de bactériémie entérococcique, PNA FISH période PNA FISH identifié E faecalis une médiane de d plus tôt et OE d plus tôt par rapport à la microbiologie standard P & lt; L’OE avait significativement plus de temps pour initier un traitement efficace d vs d; P & lt; et diminution de la mortalité par jour% vs%; P = Ly et al patients S aureus avec des cocci Gram positif dans les grappes et les hémocultures Réduction significative de la mortalité dans le groupe d’intervention par rapport au groupe de gestion standard% vs%; P =; les frais d’hospitalisation ont été moins d’environ $ dans le groupe d’intervention de la levure de la lumière PNA FISH Heil et al Candida spp patients avec hémocultures tests positifs pour la levure préimplémentation du test PNA FISH, postimplementation groupe de postimplementation: temps moyen de traitement ciblé de d vs d préimplémentation P =, temps médian à la clairance de la culture de vs d P = PNA test FISH réduit les coûts pharmaceutiques de & gt; $ par patient CAG PNA FISH Forrest et al C patients albicans avec candidémie PNA FISH facilité l’identification rapide de C albicans en Résultats de l’étude diagnostique / du test Organismes Résultats de la population Verigene: BC-GP Sango et al Enterococcus spp patients présentant une bactériémie entérococcique documentée pré-BC-GP post-BC-GP Le temps moyen d’un traitement antimicrobien approprié était plus court dans le groupe n dans le groupe pré-intervention P = Dans le groupe post-intervention, la LOS hospitalière était significativement plus courte d; P = et les coûts hospitaliers moyens étaient inférieurs à ceux du groupe de pré-intervention MALDI-TOF MS Perez et al Patients à Gram négatif avec bactériémie à Gram négatif survivant à la pré-hospitalisation, intervention SM MALDI-TOF et tests de sensibilité aux antimicrobiens réalisés directement sur des hémocultures positives combinées à une notification en temps réel et à une intervention du pharmacien d’ID a abouti à une réduction de -heure P = dans le temps de l’optimisation des antibiotiques par rapport aux méthodes conventionnelles; les résultats rapides et l’intervention ont amélioré le temps de traitement actif par h chez les patients ayant une thérapie empirique inactive P & lt; Diminution de LOS d vs d; P = et réduction des coûts hospitaliers par patient $ vs $; P = ont également été observés Huang et al Les organismes aérobies Gram positif et Gram négatif et les levures isolent les patients atteints de bactériémie ou de pré-intervention de candidémie, groupe d’intervention d’intervention: temps diminué à l’identification d’organisme de vs h, P & lt; , temps amélioré pour l’antibiothérapie efficace de vs h P =, et antibiothérapie optimale vs h; P & lt; , -diminution de jour du LOS P = et mortalité réduite% vs%; P = Clerc et al Patients à Gram négatif avec un premier épisode de bactériémie à Gram négatif conduisant à une consultation d’ID L’addition de MALDI-TOF MS pour l’identification rapide des isolats Gram négatif des hémocultures positives suite aux résultats de coloration de Gram a influencé le choix de antibiotique pour un plus grand pourcentage de patients avec une consultation d’ID comparé aux résultats de coloration de Gram seul% vs%; P = NR Wenzler et al Acinetobacter baumannii patients atteints de pneumonie et / ou bactériémie pré intervention, l’intervention MALDI-TOF MS combiné avec des interventions d’intendance a entraîné une réduction significative du temps de traitement efficace h vs h; P & lt; et augmentation de la guérison clinique% vs%; P = Perez Patients à Gram négatif ayant une bactériémie à Gram négatif résistante aux antibiotiques préintervention, intervention Les tests de diagnostic rapide avec gestion ont amélioré le temps nécessaire pour obtenir un traitement antibiotique optimal h vs h; P & lt; La mortalité parmi les patients pendant la période d’intervention était inférieure% vs%; P = Xpert SARM /

Une étude n’a pas réussi à démontrer de meilleurs résultats pour les patients ou une diminution de l’utilisation des antibiotiques avec un test microbiologique rapide chez les patients ayant des infections de la peau et des tissus mous Stieus et leurs collègues ont introduit le test Xpert MRSA / SA SSTI Les auteurs ont conclu que l’introduction d’un test de diagnostic rapide en l’absence d’une stratégie de mise en œuvre efficace pourrait être insuffisante pour produire les résultats escomptés Les staphylocoques à coagulase négative sont souvent considéré comme un contaminant d’hémocultures dans le cadre d’une seule hémoculture positive sur plusieurs flacons chez un patient sans fièvre, frissons ou hypotension. CoNS qui sont considérés comme contaminant ne nécessitent pas de traitement antimicrobien Inversement, CoNS dans plusieurs hémocultures positives nécessitent une thérapie antimicrobienne, mais souvent c La combinaison de tests diagnostiques rapides et d’interventions de gestion antimicrobienne a démontré un impact positif sur la réduction de l’utilisation d’antibiotiques inutiles et sur le traitement des patients atteints de bactériémies à CoNS. Wong et ses collègues ont évalué la valeur de Xpert MRSA / SA BC dosage et interventions de pharmacien de maladie infectieuse dans les patients avec une hémoculture positive pour CoNS Les auteurs ont rapporté plusieurs résultats notables, en incluant que les antibiotiques antistaphylococcic ont été arrêtés des heures plus tôt P & lt; à partir du moment du résultat de la PCR, l’exposition totale aux antibiotiques a diminué de plusieurs heures P & lt; , la durée du séjour liée à l’infection a diminué de plusieurs jours P & lt; Fait important, le pharmacien a initié la vancomycine chez% des patients avec une bactériémie à CoNS Une étude rétrospective de Forrest et al a montré que PNA FISH réduit l’utilisation de la vancomycine pour la bactériémie CoNS, avec des réductions ultérieures. en durée médiane de séjour à jours P & lt; En revanche, Holtzman et ses collègues ont été incapables de démontrer un impact sur la durée du séjour à l’hôpital ou la durée de la vancomycine avec le PNA FISH chez les patients atteints de bactériémie à CoNS. Les entérocoques sont des cocci à Gram positif qui représentent le troisième type d’agents pathogènes associés aux soins de santé aux États-Unis. Les entérocoques sont intrinsèquement résistants à de nombreux antibiotiques et à de nombreux antibiotiques. peut également acquérir des déterminants de résistance supplémentaires, y compris pour la résistance à la vancomycine La bactériémie à Enterococcus résistante à la vancomycine est associée à des résultats suboptimaux chez les patients, y compris une mortalité accrue; La thérapie empirique contre les bactériémies entérococciques comprend la vancomycine, la daptomycine ou le linézolide Avec l’identification rapide des organismes, y compris les déterminants de la résistance, les programmes de gestion des antimicrobiens peuvent initier et optimiser le traitement plus rapidement, améliorant ainsi les résultats des patients. l’impact de l’identification rapide des organismes et la détection de la résistance avec le test Verigene BC-GP chez les patients atteints de bactériémies entérococciques Un pharmacien infectiologue ou infectiologue a été contacté pour les résultats du test et a ensuite recommandé un traitement efficace au clinicien traitant. le traitement antimicrobien était plus court dans le groupe post-intervention que dans le groupe pré-intervention. P = Dans le groupe post-intervention, la durée du séjour hospitalier était significativement plus courte; Forrest et ses collègues ont démontré les avantages du PNA FISH E faecalis et d’autres sondes d’entérocoques avec la gestion des antimicrobiens sur les résultats des patients Ils ont évalué & gt; patients atteints de bactériémies entérococciques Toutes les cultures d’E faecalis étaient sensibles à l’ampicilline, mais% étaient résistantes à la vancomycine alors que les autres entérocoques, qui étaient tous en E faecium, étaient% résistants à l’ampicilline et% résistants à la vancomycine. linézolide au clinicien prescripteur si le résultat était d’autres entérocoques PNA FISH identifié E faecalis une médiane des jours plus tôt et d’autres entérocoques jours plus tôt par rapport à la microbiologie standard P & lt; Les autres entérocoques ont également eu un temps significativement plus court à l’initiation de jours de traitement efficaces par rapport aux jours; P & lt; et diminution de la mortalité par jour% vs%; P = Gamage et al ont rapporté des résultats similaires, avec un temps de traitement approprié décroissant de jours en jours P & lt; et des réductions significatives de la mortalité chez les patients en réanimation P =

Gram-Organismes Négatifs

Les infections à Gram négatif sont souvent associées à des résultats suboptimaux chez les patients, notamment une durée de séjour prolongée, la mortalité et les coûts des soins de santé Malheureusement, un nombre accru d’organismes Gram négatif sont devenus multirésistants , et le pipeline antibiotique est limité pour le traitement de ces infections Cela a conduit à l’utilisation de combinaisons d’antibiotiques et d’antibiotiques relativement toxiques. Il est urgent de combiner des tests microbiologiques rapides avec des interventions d’intendance dans le traitement des gram négatif. infections Le «feu de circulation» PNA FISH peut identifier une variété d’organismes Gram négatif provenant d’hémocultures positives. Le test peut identifier E coli, P aeruginosa et K pneumoniae où E coli fluorescent vert, P aeruginosa rouge et K pneumoniae jaune ont évalué l’impact de ce test sur les résultats des patients, ce qui reflète la limitation de PNA FISH dans son incapacité à identifier les gènes de résistance chez les organismes Gram négatif, forçant les membres et les prestataires de l’intendance à s’appuyer sur l’antibiogramme de l’hôpital pour diriger la thérapie empirique. Un nombre limité d’études ont évalué les bénéfices de MALDI-TOF MS. Clerc et al. ont constaté que l’ajout de MALDI-TOF MS pour l’identification rapide des isolats Gram négatif issus de cultures sanguines positives après coloration au Gram influait sur le choix des antibiotiques pour un plus grand pourcentage de patients avec une consultation d’ID, comparativement aux résultats de coloration de Gram. seul% vs%; P pas rapporté Perez et collègues ont constaté que chez les patients atteints de bactériémie à Gram négatif, MALDI-TOF MS et tests de sensibilité aux antimicrobiens effectués directement sur des hémocultures positives, combinés avec la notification en temps réel et l’intervention pharmacologique des maladies infectieuses, ont donné une heure réduction P = dans le temps de l’optimisation de l’antibiotique, par rapport aux méthodes conventionnelles En outre, des résultats rapides et l’intervention ont amélioré le temps de traitement actif par heures chez les patients ayant une thérapie empirique inactive P & lt; Il est important de noter que la durée du séjour diminue en fonction du nombre de jours; P = et réduction des coûts hospitaliers par patient $ vs $; P = ont également été observés Huang et ses collaborateurs ont évalué l’impact de la SM MALDI-TOF et l’intervention de la gérance chez les patients atteints de bactériémie ou de candidémie Comparé aux méthodes traditionnelles, l’impact de MALDI-TOF MS combiné à la notification en temps réel de l’équipe d’intendance a donné lieu à une pause P & lt; et -heure P = réduction du temps pour l’optimisation des antibiotiques et la thérapie active, respectivement. En outre, diminution d’une journée de la durée moyenne du séjour P = et réduction de la mortalité% vs%; Perez et al ont évalué les effets cliniques et économiques de l’identification rapide avec MALDI-TOF MS et des tests de sensibilité associés à une gestion active des antimicrobiens chez les patients présentant des infections sanguines causées par des multirésistances et / ou des BLSE. bactéries gram-négatives productrices L’intégration des diagnostics rapides à la gestion des antimicrobiens a amélioré le temps nécessaire pour obtenir des heures optimales de traitement antibiotique pendant la période de pré-intervention par rapport aux heures de la période d’intervention; P & lt; Fait important, la mortalité chez les patients au cours de la période d’intervention était inférieure% vs%; P = Tamma et ses collègues ont évalué des patients hospitalisés dont les isolats cliniques ont été testés en utilisant des méthodes standard et MALDI-TOF MS Les auteurs ont déterminé que MALDI-TOF MS pourrait réduire le temps de traitement approprié pour% et% patients selon les choix du médecin traitant. Enfin, Wenzler et al ont mené une étude pour évaluer l’impact de la SM MALDI-TOF et de l’intervention d’intendance chez les patients atteints de pneumonie à Acinetobacter baumannii et / ou de bactériémie. Les auteurs ont démontré une réduction significative du temps pour des heures thérapeutiques efficaces vs heures; P & lt; et augmentation de la guérison clinique% vs%; P = avec l’utilisation de MALDI-TOF MS combiné avec des interventions d’intendance Cette étude a démontré des avantages similaires observés dans des études antérieures, mais, surtout, chez des patients infectés par un organisme multirésistant aux médicaments associé à une pneumonie et / ou bactériémie

Candida Espèces

La candidémie représente la quatrième cause la plus fréquente d’infection sanguine nosocomiale aux États-Unis Le temps nécessaire à l’hémoculture positive et à l’identification des espèces peut prendre plusieurs jours à partir du moment où l’hémoculture est établie. mortalité, si un traitement antifongique n’est pas administré jusqu’à confirmation de la candidémie Actuellement, des sondes PNA FISH sont disponibles: la sonde C albicans / glabrata CAG et le feu YTL YTL peut détecter C albicans / C parapsilosis comme fluorescence verte, C glabrata / krusei en fluorescence rouge, et C tropicalis en fluorescence jaune Une étude a montré que PNA FISH combiné à une gestion antimicrobienne entraînait une réduction significative de l’utilisation de la caspofongine et une économie de coûts de $ par patient Une seconde institution a mis en place la sonde CAG FISH avec la susceptibilité directe au fluconazole, mais n’a pas pu démontrer de bénéfices, car les prestataires n’ont pas utilisé les résultats Au lieu de cela, une autre institution a signalé une amélioration d’une journée du traitement approprié, ce qui a entraîné des économies antifongiques de $ par patient et de l’ensemble des patients. Les résultats ont été reproduits dans une institution différente qui a non seulement démontré des économies de coûts de presque $ million, mais aussi une mortalité réduite de% avant la mise en œuvre du PNA FISH en% après la mise en œuvre. ; Heil et al ont évalué la sonde YTL PNA FISH avec une intervention d’intendance. La sonde YTL a identifié les jours d’espèces de Candida plus tôt, ce qui a eu pour résultat une approche orientée vers le traitement avec la possibilité d’identifier les espèces de Candida les plus communes. dans un temps réduit à la thérapie ciblée P = et le temps de clairance de la candidémie P =, et significativement influencé positivement le budget de la pharmacie avec des économies de> $ par patient

Clostridium difficile

Clostridium difficile est devenu une infection de plus en plus difficile avec une augmentation de la sévérité de la maladie, des échecs cliniques et des récidives De plus, l’épidémiologie a considérablement changé ces dernières années avec l’émergence d’une souche nord-américaine en électrophorèse en champ pulsé / ribonucléase de restriction BI / PCR ribotype [NAP / BI /] Cette souche montre une augmentation de la production de toxines, contribuant à une proportion plus élevée de maladies sévères et une réponse réduite au traitement traditionnel Historiquement, le test de neutralisation des cytotoxines in vitro Cependant, de nombreux laboratoires se sont appuyés sur le dosage immuno-enzymatique rapide, la détection de la toxine A, la toxine B, ou les deux. Les deux méthodologies manquent de sensibilité et de capacité à fournir des résultats rapides. Une technologie supplémentaire, l’amplification isotherme à médiation par boucle, est également disponible. Note, PC La technologie R est le test le plus sensible pour C difficile; Par conséquent, le taux de tests positifs peut plus que doubler en milieu hospitalier Pour cette raison, il est impératif que les programmes de gestion des antimicrobiens dispensent une formation aux prestataires et à l’administration hospitalière avant la mise en œuvre des tests PCR. devrait également interdire aux fournisseurs de prescrire des tests quotidiens, car la valeur prédictive positive diminue de façon significative avec des tests répétés. Actuellement, aucune étude publiée n’évalue l’impact des tests de C difficile en combinaison avec la gestion des antimicrobiens.

CONSIDÉRATIONS POUR LES PROGRAMMES D’INTENDANCE ANTIMICROBIENNE

Les méthodes microbiologiques rapides offrent des possibilités collaboratives pour les programmes d’intendance antimicrobienne de travailler avec l’administration, les médecins et le personnel de laboratoire de microbiologie pour améliorer les résultats des patients et réduire l’utilisation des antimicrobiens abdomen. Il est impératif que les programmes de gestion des antimicrobiens jouent un rôle actif. Les tests diagnostiques rapides ont peu de valeur si un programme d’intendance antimicrobienne n’a pas un rôle de messager actif et d’éducateur des résultats. Des études ont notamment démontré que les résultats rapides ont peu de valeur si les tests ne sont pas mis en œuvre rapidement. Il est important de considérer quels tests microbiologiques seront mis en œuvre et devraient être basés sur les organismes prévalents ou problématiques dans le milieu hospitalier. Il faut également tenir compte de la sensibilité et de la spécificité de chaque test, étant donné qu’il existe une variabilité entre les différentes technologies et organismes de diagnostic rapide. Le personnel de microbiologie et les membres de l’intendance devraient également considérer le prix d’achat ou le contrat de location de l’instrument, le coût d’un microscope à fluorescence pour PNA FISH, les fournitures d’essai, l’espace de laboratoire et la complexité du test. interface avec diverses plates-formes de sensibilité Actuellement, MALDI-TOF MS n’a qu’une interface avec la plate-forme Vitek Il est obligatoire que le personnel de laboratoire de microbiologie et les membres de la gestion des antimicrobiens travaillent ensemble pour déterminer la meilleure approche pour justifier les coûts institutionnels globaux des tests. Les programmes d’intendance des antimicrobiens doivent fournir une documentation appropriée, y compris éviter l’utilisation inutile d’antimicrobiens, effectuer des tests supplémentaires et réduire les infections associées à la diminution des infections due à la réduction de la transmission des organismes.documenter les résultats cliniques et économiques associés à chaque test afin de démontrer de façon appropriée les avantages pour l’amélioration des soins aux patients

Preimplementation Identifier le TDR le plus utile basé sur la prévalence de pathogènes hospitaliers ○ Exemple: Nombre de bactériémies à Staphylococcus aureus, nombre de staphylocoques à coagulase négative, nombre de Pseudomonas aeruginosa, nombre d’espèces de CandidaIdentifier le coût hospitalier de l’infection ○ Exemple : ▪ Utiliser le personnel de l’entrepôt d’information pour extraire les coûts selon les données de mortalité du code de la CIM. ▪ Obtenir du temps pour consulter un spécialiste. ▪ Durée du séjour▪ réadmission dans les trois jours Délai de mise en œuvreTraitement du TDR validé par un microbiologisteDéterminer si le test est effectué en temps réel. Les résultats du TDR du microbiologiste au médecin et du pharmacien ASP sont établis. Le pharmacien-médecin du PPS éduque le personnel médical. Documents du PAA Interventions et taux d’acceptation Postimplementation Temps pour un traitement efficaceTemps d’arrêt ou de désescaladeTemps pour l’ID consult ○ Exemple: Nombre de bactériémies à Staphylococcus aureus, nombre de staphylocoques à coagulase négative, nombre de Pseudomonas aeruginosa, nombre d’espèces de CandidaIdentifier le coût hospitalier de l’infection ○ Exemple: ▪ Utiliser le personnel de l’entrepôt d’information pour tirer le coût par les données de mortalité du code ICD. ▪ Obtenir du temps pour consulter un spécialiste en identification. Length Durée du séjour read réadmission T délai de traitement efficace Implementation Instrument de TDR validé par un microbiologisteDéterminer si le test est effectué en temps réel d’un microbiologiste à un médecin et un pharmacien ASP est établiPharmaciste pharmacien -PAS éduque le personnel médicalASP documents interventions et le taux d’acceptation Postimplementation Temps de traitement efficaceTemps d’abandon ou de désescaladeTime à l’ID consultéeDocumentation négative documentée avant la sortie de l’hôpital réadmission ge-dayMortalité Abréviations: ASP, programme de gestion des antimicrobiens; CIM-, Classification internationale des maladies, neuvième révision; ID, maladies infectieuses; RDT, test de diagnostic rapideViewFinalement, plusieurs sociétés pharmaceutiques ont récemment collaboré avec des sociétés de diagnostic rapide afin d’aider à apporter des changements transformationnels dans le domaine des maladies infectieuses Cepheid s’est associé à Cubist Pharmaceuticals, AstraZeneca et GlaxoSmithKline pour développer le Test moléculaire rapide Xpert Carba-R pour identifier les bactéries gram-négatives produisant des carbapénémases Merck Global Health Innovation finance l’expansion des tests de diagnostic rapide d’AdvanDx La collaboration entre ces sociétés aidera à fournir des outils supplémentaires dans la boîte à outils des agents antimicrobiens

CONCLUSIONS

Dans le traitement des infections, l’administration en temps opportun du traitement antimicrobien est essentielle pour optimiser les résultats des patients. Les technologies microbiologiques rapides combinées à la gestion des antimicrobiens ont permis de réduire significativement le temps de traitement approprié et d’optimiser les résultats cliniques et économiques, y compris coûts des soins de santé Il est probable que la combinaison des tests microbiologiques rapides et de la gestion des antimicrobiens continuera de démontrer des améliorations significatives des résultats pour les patients et de l’utilisation des antimicrobiens.

Remarques

Remerciements La rédaction et le soutien éditorial ont été fournis par ApotheCom ScopeMedical Yardley, Pennsylvanie et financé par le parrainage de Cubist Pharmaceuticals. Cet article fait partie d’un supplément intitulé «Antimicrobial Stewardship: Patients Over Process», parrainé par Cubist Pharmaceuticals. son institution de Cubist Pharmaceuticals, sert de conférencier pour Merck et Astellas Pharma, et a participé à des conseils consultatifs pour Forest, The Medicines Company, Bayer, Durata, Cubist Pharmaceuticals, et Astellas KAB a reçu un soutien de recherche à son institution de Cubist Pharmaceuticals et a participé à des comités consultatifs pour Cubist Pharmaceuticals et Theravance Tous les autres auteurs ne signalent aucun conflit potentiel Tous les auteurs ont soumis le formulaire ICMJE pour la divulgation des conflits potentiels de conflits d’intérêts que les éditeurs considèrent comme pertinents pour le contenu du manuscrit. divulgué